Die Mittel der GLS Treuhand stammen ausschließlich von zahlreichen Schenkerinnen und Schenkern. Darunter sind viele private Einzelspenden oder Anteile an Erbschaften. Treuhänderische Stiftungen und Stiftungsfonds beteiligen sich solidarisch nach Vermögenshöhe an den Gemeinkosten durch eine Umlage. 

Das Vermögen der GLS Treuhand wird in sozial-ökologischen Unternehmungen aktiv im Sinne eines „Impact Investing“ investiert. Auch diese Vermögenserträge dienen gemeinnützigen Förderungen und der Deckung der administrativen Kosten.